清晨，整個世界是清亮的，陽光透過淡淡的震氣，溫柔地灑在萬物上，別有一番賞心悅目的感覺。
  滬鼎生物報道：自上個世紀90年代中期全基因組測序技術出現后，一種新技術方法也隨著迅猛發展，這種稱為基于約束的通量分析的方法通過一系列針對基于約束的構建和模擬用途而編寫的函數進行模擬運算。  
  近幾年COBRA已經被用于預測細胞的功能，比如預測不同基質條件下細胞生長的能力，以及基因敲除在全基因組范圍內的影響。不少科學家們希望能了解并應用這種方法，尤其是在代謝工程，抗生素設計和酶研究方面。
  全基因組范圍的代謝網絡在基因組序列的基礎上，結合基因功能注釋信息，把基因編碼蛋白所催化的生化反應構建為一個代謝網絡，反應了基因-蛋白質-生化反應之間的相互作用，從而有效地轉化為數學模型在計算機上進行模擬、分析，并用實驗數據加以驗證，提出假設。
  這種網絡能從全局的角度探索和揭示生物代謝機制提供一個有效的框架，很好地將基因型與表型的關系定量地關聯起來。目前科學家們已經構建了包括真菌、古生菌和真核生物在內的多種代謝網絡。
  而要進行這種構建，COBRA是一種重要的方法，這種方法是由一系列針對基于約束的構建和模擬用途而編寫的函數組成，含有可以讀取SBML或Excel格式的模型的函數，使用者不再需要自己編寫提取矩陣的程序。
  此前研究人員就利用這種方法，對大腸桿菌E. coli的1,366個基因進行了計算機建模，該代謝模型包含了蛋白質的三維結構數據，能夠預測特定細菌蛋白對溫度的敏感程度。
在基因組規模上對細胞網絡進行重建，可以建立預測性的代謝模型，不過一般這樣的研究都沒有包括蛋白的結構信息。研究人員在建模過程中，添加了蛋白的結構數據，實現了對蛋白熱穩定性的系統性研究。該模型可以預測在非*溫度下限制整個系統功能的蛋白，還可以確定能增強細胞耐熱能力的突變。在此基礎上，人們將有望構建更耐熱的微生物菌株用于工業生產，例如生產常用化學物質或治療性蛋白等。
  ELISA試劑盒研究人員模擬了來自人類病原菌支原體整個生命周期，提出了一個全細胞計算機模型，這一模型囊括了這個病原菌的所有分子組，以及相互作用，這將有助于促進細胞生物學的發展。
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